天才海豚伯尼意外获得能听懂人类心声的能力，却因此被邪恶海洋乐园老板盯上。
在上一集拯救海洋馆后，伯尼与少年小杰成了形影不离的伙伴。某天伯尼被一道神秘海底声波击中，竟能读懂人类想法。小杰发现后惊喜不已，两人合作更默契。但邪恶的海洋乐园老板哈维得知此事，企图抓捕伯尼做盈利性实验。小杰带着伯尼逃亡途中，遇到研究海洋哺乳动物的女博士艾琳。艾琳起初怀疑伯尼的能力，亲眼见证后决定相助。哈维团队利用声波干扰器追踪，伯尼的能力开始失控，听到太多痛苦心声而濒临崩溃。最终小杰和艾琳设计反干扰装置，在废弃码头展开决战。伯尼重新掌控能力，用智慧引哈维团队落入渔网。影片结尾，伯尼回归大海，但会定期游回码头与小杰击鳍告别。
续集在特效上明显升级，海豚伯尼的微表情栩栩如生。故事虽简单，但关于“倾听他人痛苦”的议题嵌入自然，不显说教。高潮部分的声波视觉化呈现极具想象力，是一部温暖又有节奏的合家欢。
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